Żaden program antywirusowy nie daje stu procentowej gwarancji bezpieczeństwa. Każde zabezpieczenie da się obejść. Należy zatem powiedzieć, że darmowy program antywirusowy nie zabezpiecza komputera tak dobrze jak płatne odpowiedniki. Dzieje się tak głównie przez ograniczenia jakie wypływają z używania darmowych wersji. Niejednokrotnie mogą one wykonywać jedynie skanowanie na żądanie, nie skanują wszystkich plików jakie są kopiowane lub pobierane na komputer. Niekiedy brak im także aktualizacji automatycznych czy modułu heurystyki (pozwala ona na wykrywanie szkodników, których nie ma jeszcze w sygnaturach). Te braki narażają użytkownika na niebezpieczeństwo.